Meedの使用法 1.虎谷さんリートベルト結果PFLSよりIobsテーブル部分を切り出してファイル化 CalcFobsForMeed.xlsに入力する。 2.reflex?.dの結果ファイルより2θ値部分をやはり CalcFobsForMeed.xlsに入力する。 2.5.CGRAPHのスクリプトcalf.xによりPhaseを計算して やはりCalcFobsForMeed.xlsに入力する。 3.CalcFobsForMeed.xlsのオレンジ色部分に計算結果が表示されるので その部分をコピーする。 4.適当なエディターでMeed入力ファイル*.MEMのFobsデータの部分に 3.でコピーした部分を張り付ける。 CalcFobsForMeed.xlsの記述に従ってデリミタのタブコードをスペースに 変換する。 5.*.memの必要部分を書き換える。 ・タイトル ・格子定数 ・空間群 ・分割数 ・全電子数 ・反射数 etc. # Title ( up to 70 character ) ScRh3Bx(x=1.0) ( 1.2( A ) Powder X-ray Data by M.Tanaka ) # a b c alpha beta gamma 4.05587 4.05587 4.05587 90.00000 90.00000 90.00000 # P.O. correction # When TORAYA & MARUMO type function is used, add 'P' option. # IPTYP : -1 = No Correction, 0 = Plate Like, 1 = Needle Like # POP1 POP2 IPTYP JPH JPK JPL 0.0000000 0.0000000 -1 0 0 0 P # SPG ORG NX NY NZ 221 1 64 64 64 # Total charge lambda 161.0000000 0.0000100 # NREF1 49 # h k l Fo(R) Fo(I) sigma(F) 1 0 0 25.9900000 0.0000000 0.1040015 1 1 0 21.3247627 0.0000000 0.1462755 1 1 1 127.9330945 0.0000000 0.1781152 2 0 0 126.6260638 0.0000000 0.2044778 2 1 0 24.2616207 0.0000000 0.2272062 ・ ・ ・ ・ ・ 6.*.cntを書き換える。 ・ファイル名 ・初期電子密度の取り扱い(特に最初に注意) ・繰り返し回数 7.job.comを書き換える *.cntのファイル名 8.バッチジョブを投入 bsub -q c job.com Job statusをみるには bjobs 9.等高線マップを書く meedの出力ファイル*.denをu2x.exeにてwindows改行コードの ファイルにする。 u2w < *.den > *2.den VBcontourを起動ファイル、読み込みでMeed出力形式(3番)を選んで 読み込み。