開催概要

 クライオ電子顕微鏡によるタンパク質やその複合体の単粒子解析は、電子直接検出器、位相板、解析ソフトウェアの開発といった技術革新が起こり、分解能革命と呼ばれる時代の中にあります。現在、世界では結晶化の難しいタンパク質複合体などの構造解析を行うための最新鋭の電子顕微鏡装置の導入が進められています。こちら高エネルギー加速器研究機構(KEK)・物質構造科学研究所・構造生物学研究センターにおいても、日本医療研究開発機構(AMED)の創薬等先端支援技術基盤プラットフォーム事業(BINDS)を通じ、電子直接検出器Falcon 3を備えた200 kVの電子顕微鏡Talos Arctica (Thermo Fisher Scientific社)を導入しました。現在は、クライオ電顕の初期トレーニングを行うと共に、施設の共同利用を開始し、ユーザーの方々の構造解析用サンプルのスクリーニングやデータ測定が行われています。
 このような状況の下、クライオ電子顕微鏡によるタンパク質の単粒子解析に興味はもっているものの、実際にご自身では解析されたことがない初心者の方を対象に、構造解析ソフトウェアRELION-3.0beta(Sjors Scheres, MRC-LMB)を中心としたデータ解析講習会を開催いたします。講師には、九州工業大学の安永卓生先生をお招きし、RELIONを使ったクライオ電子顕微鏡による単粒子解析の概要について講義を行っていただくと共に、解析実習など、各自で実際にStep by Step方式で電顕データの処理を体験していただきます。皆様、ぜひご参加ください。

主催

関連事業

日時

2018年12月13日(木)~14日(金)

会場

高エネルギー加速器研究機構・研究本館(12/13)、4号館(12/14)
 高エネルギー加速器研究機構
 〒305-0801 茨城県つくば市大穂1-1
→交通アクセスはこちらをご覧ください。 

 会場のご案内(施設案内Map
 キャンパス内の会場については後日お知らせします。

講師

安永卓生:九州工業大学情報工学部

実習インストラクター

重松秀樹:理化学研究所/SPring-8
守屋俊夫:KEK・物質構造科学研究所・構造生物学研究センター
荒牧慎二:Tietz Video & Image Processing Systems GmbH

宿泊および食事

 本講習会は、1泊2日のプログラムですが、機構内のドミトリー(1500もしくは2000円/1泊)を利用することが可能です。12日夜から前泊することもできます。
※ドミトリーの利用は数に限りがありますので、先着順となります。
※講習会中の食事は、キャンパス内の食堂および喫茶室にて取ることが可能です。 1日目の講習会終了後には懇親会を開催します。

募集対象と人数

 本講習会は、クライオ電子顕微鏡解析のご経験がないか、ほとんど無い方を対象としています。なお、学生の方は指導教員に了解を得ていただきますようお願いします。

定員:25名 (※ 応募者多数の場合には、各グループからの参加者数などを調整させていただくことがございます。予め、ご了承ください。)

参加条件:解析実習に使うため、WiFi接続が可能なノート型パソコンをお持ちください。企業の方など、ノートパソコンの持ち込み・接続ができない方は、別途問い合わせてください。数に限りがありますが、ノート型パソコンの貸出も可能です。

今回の講習会は、Cloud上にRelionによる解析環境を開催者側で用意し、そこに参加者の皆様のノートパソコンからアクセスしていただいて 、解析していただくことになります。従いまして、高性能のCPUやGPUを掲載したノートパソコンを持ってきていただく必要はございません。通常、 ラボでデータ取りまとめ用などで使われているものでも、十分お使いいただけるものと考えています。Windows、Mac、どちらでも構いません。


参加費

講習会:無料
交通費宿泊費の補助はありません。

プログラム(仮)

12月13日(木) 研究本館1階 小林ホール

 
内 容
10:00-10:10 はじめに
 千田俊哉(KEK)
10:10-10:30 Cloudデータ解析環境設定
 山田悠介(KEK)
10:30-12:30 解析実習1 (講演 + 実習を交互に行います。)
 安永卓生(九工大)
12:30-13:30 昼食
13:30–15:00 解析実習2
15:00-15:20 休憩
15:20-16:50 解析実習3
16:50-17:00 休憩
17:00-18:00 解析ツールの紹介
 守屋俊夫(KEK)
18:30-20:30 懇親会

12月14日(金) 4号館2階 輪講室

9:30-10:30

電顕構造解析例の紹介
 重松秀樹(理研)
10:30-12:30 解析実習4
12:30-13:30 昼食
13:30-15:00 解析実習5
15:00-15:20 休憩
15:20-16:50 解析実習6
16:50-17:20 全体 Q & A + ディスカッション
17:20-17:30 終わりに

 

お申し込み

お申し込み方法

 締め切りました。

締め切り

 2018年10月31日(水)

お問い合わせ

世話人:
KEK・物質構造科学研究所・構造生物学研究センター
湯本史明
電話:029-864-5200 ex 4716
e-mail: fumiaki.yumoto[at]kek.jp

事務局:
増田千穂
電話:029-879-6176
e-mail: cmasuda[at]post.kek.jp

<お知らせ>

2018/10/18
申込を開始しました。

2018/11/5
お申込を締め切りました。